合并会计报表有局限性表现在：

(1)母公司和子公司的债权人对企业的债权清偿权通常针对独立的法律主体，而不针对作为经济实体的企业集团，合并报表所反映的资产不能满足母、子公司债权人的清偿要求。

(2)合并会计报表将母公司及子公司的个别会计报表合并起来，子公司的少数股东难以从中直接得到他们所需的决策有用信息，如他们所投资的子公司资金运用的信息。

(3)利润分配包括向股东分派股利，要以个别会计报表为据，合并会计报表则不能为股东预测和评价报表为据，合并会计报表则不能为股东预测和评价母公司和所有子公司将来分派股利提供依据。

合并会计报表的作用

合并会计报表的作用主要表现在两个方面：

1.合并会计报表能够对外提供反映由母子公司组成的企业集团整体经营情况的会计信息。

在控股经营的情况下，母公司和子公司都是独立的法人实体，分别编制自身的会计报表，分别反映企业本身的生产经营情况，这些会计报表并不能够有效地提供反映整个企业集团的会计信息。为此，要了解控股公司整体经营情况，就需要将控股公司与被控股公司的会计信息综合起来编制会计报表，以满足企业集团管理当局强化对被控股企业管理的需要。

2.合并会计报表有利于避免一些企业集团利用内部控股关系人为粉饰会计报表情况的发生。

控股公司的发展也带来了一系列新的问题，一些控股公司利用对子公司的控制和从属关系，运用内部转移价格等手段，如低价向子公司提供原材料、高价收购子公司产品，出于避税考虑而转移利润;再如通过高价对企业集团内的其他企业销售，低价购买其他企业的原材料，转移亏损。通过编制合并会计报表，可以将企业集团内部交易所产生的收入及利润予以抵消，使会计报表反映企业集团客观真实的财务和经营情况，有利于防止和避免控股公司人为操纵利润，粉饰会计报表现象的发生。